Cool, j'ai fini par trouver la bonne procédure (merci Summilux !) :
1) Formater la carte mémoire à l'aide du boîtier
2) Prendre une nouvelle photo avec le boîtier
3) Charger la carte mémoire sur votre ordinateur et renommer la photo que vous venez de prendre avec le bon numéro de vue
4) Optionnel : Ne pas oublier de renommer aussi le cas échéant le nom du dossier sur la carte mémoire (ex. : remplacer 100LEICA par 102LEICA si la numérotation de vos photos commencent par L102xxxx.dng)
5) Replacer la carte mémoire dans le boîtier et prendre de nouvelles photos